Minuli rezultati u oblasti doktorskih i magistarskih studija nisu pravo merilo, budući da je Fakultet osnovan pre 11 god., a izrada i odbrana doktorskih disertacija, po ranije važećim propisima, organizuje svega šest godina. Međutim, Fakultet ima osnovne preduslove za organizaciju doktorskih studija:

• ima dugoročni i kratkoročni program naučnoistraživačkog rada i razvoja naučnoistraživačkog podmlatka.
• akreditovan je kao naučnoistraživačka ustanova ( Rešenje br. 021-01-061/107 od 23.06.2008. god.  Ministarstva za nauku i tehnologiju Republike Srbije)
• do sada je na Fakultetu odbranjeno  13 doktorskih disertacija i 28 magistarskih radova
• nastavnici koji će izvoditi nastavu na studijskom programu Doktorskih studija menadžmenta imaju naučne i stručne konpetencije za nastavu na doktorskim studijama, a veći deo imaju i kompetencije, u skladu sa standardima, da mogu biti mentori kandidatima na doktorskim studijama.

Studijski program Doktorskih studija menadžmenta ima jasno defi-nisane ciljeve i elemente propisane Standardima za akreditaciju doktorskih studija:

1. doktorske studije menadžmenta imaju za cilj da osposobljavaju kandidate za samostalan kreativni naučnoistraživački i nastavni rad i razvoj karijere u poslovnom svetu
2. ishod studija je potpuno ovladavanje metodološkim i teoretskim znanjima neophodnih za vlastiti angažman i doprinos razvoju nauke o menadžmentu, koji se ogleda kroz:
   • samostalno rešavanje praktičnih i teorijskih problema;
   • uključivanje u realizaciju međunarodnih naučnih projekata;
   • koncipiranje i realizacija programa istraživanja u cilju razvoja novih metoda i postupaka menadžmenta, modeliranja i optimizacije poslovnih procesa i razvoja teorije odlučivanja;
   • samostalno kritičko ocenjivanje i vrednovanje postojećih i razvoj novih znanja;
   • poštovanje principa etičkog kodeksa dobre naučne prakse;
   • saopštavanje naučno-istraživačkih rezultata na naučno-stručnim konferencijama i u naučnim časopisima; i
   • doprinos razvoju nauke o menadžmentu i nauke uopšte.
3. uspešnom izradom i odbranom doktorske disertacije stiče se akademski naziv: doktor nauka - menadžment i biznis
4. na doktorske studije menadžmenta mogu se upisati kandidati koji su:
   • završili diplomske akademske studije sa najmanje 300 ESPB bodova i opštom prosečnom ocenom najmanje 8 na osnovnim akademskim i diplomskim akademskim studijama menadžmenta, ekonomije i organizacionih nauka.
   • završili studije VII-1 stepena  menadžmenta, ekonomije i organizacionih nauka po ranije važećim propisima sa opštom prosečnom ocenom najmanje 8, i
   • završili studije u drugim naučnim područjima, ako imaju najmanju prosečnu ocenu  na prethodnim studijama 8 i polože diferencijalne ispite iz predmeta: Ekonomija i Menadžment po programu za osnovne akademske studije.
5. Studijski program  doktorskih studija obuhvata četiri obavezna predmeta teorijsko-metodološkog karaktera, jedan izborni predmet iz užeg naučnog područja u kojoj se kandidat opredeli da radi doktorsku disertaciju, studijski istraživački rad i kvalifikacioni rad za izbor teme doktorske disertacije, izradu i odbranu doktorske disertacije.

   Struktura studijskog programa u pogledu broja i vrste obaveznih i izbornih predmeta je usklađena sa Standardima za akreditaciju,  savremenim pravcima razvoja nauke o menadžmentu i usaglašen sa programima doktorskih studija menadžmenta na vodećim evropskim i svetskim univerzitetima.

6. od ukupnog fonda časova aktivne nastave na obaveznim i izbornim predmetima 25% se realizuje putem predavanja, a 75%  kroz studijski istraživački rad, konsultacije i mentorski rad u cilju potpunog ovladavanja metodologijama istraživanja, obrade rezultata i pisanja radova. Uspešnim savladavanjem programa studija na odgovarajućem predmetu stiče se odgovarajući broj ESPB bodova , u skladu sa potrebnim vremenom za savladavanje studijskog programa.
7. neposrednom izboru teme, izradi i uspešnoj odbrani doktorske disertacije pripada ukupno 90 ESPB bodova, od čega 30 bodova studijskom istraživačkom radu i kvalifikacionom radu za izbor teme doktorske disertacije, a 60 ESPB bodova izradi i uspešnoj odbrani doktorske disertacije.
8. za prijavu teme doktorske disertacije, kandidat treba da ispuni sledeće uslove:
   • uspešno položeni svi ispiti iz obaveznih predmeta
   • izveden odgovarajući studijski istraživački rad i urađen kvalifikacioni rad za izbor teme doktorske disertacije koji je pozitivno ocenjen od mentora. Kvalifikacionim radom  kandidat treba da pokaže da apsolutno vlada teorijom i praksom u užoj naučnoj oblasti u kojoj želi da radi doktorsku disertaciju kao i da odgovarajućim obrazloženjem dokaže da predložena tema može biti predmet doktorske disertacije kroz koju će kandidat dati originalan doprinos nauci o menadžmentu.
9. ispiti položeni na magistarskim ili specijalističkim studijama kao i ispiti položeni na drugim doktorskim studijama mogu se priznati ako su po sadržaju indentični najmanje 80 % i ako od datuma njihovog polaganja nije prošlo više od 5 godina. Priznavanje ispita vrši se po proceduri definisanoj u Pravilima studija na Fakultetu za menadžment u Zaječaru.
10. kandidat može da pristupi odbrani doktorske disertacije ako su ispunjeni sledeći uslovi:
    • položeni svi ispiti
    • ima najmanje dva rada objavljena ili prihvaćena za objavljivanje u naučnim časopisima sa recenzijama sa zvanične liste Ministarstva za nauku i tehnologiju Republike Srbije ili jedan rad u međunarodnom časopisu sa SCI liste, iz okvira teme doktorske disertacije,  i
    • pozitivno ocenjena doktorska disertacija od komisije određene odlukom Nastavno-naučnog veća Fakulteta

Studijski program doktorskih studija menadžmenta ima jasno definisanu svrhu i ulogu u obrazovnom sistemu, a svodi se na sledeće osnovne  ciljeve:

• osposobljava kandidate za samostalan kreativni naučnoistraživački rad, razvoj kritičkog mišljenja i procenjivanje istraživanja drugih i vođenje originalnih istraživanja naučno relevantnih za doprinos razvoju nauke o menadžmentu;
• postizanje naučnih sposobnosti i akademskih veština, razvoj kreativnih sposobnosti i ovladavanje specifičnim praktičnim veštinama potrebnim za razvoj karijere, a svode se prevashodno na sledeće:
• potpuno ovladavanje teoretskim znanjima i metodologijama neophodnih za vlastiti angažman i doprinos razvoju nauke o menadžmentu i razvoju naučnoistraživačkog podmlatka
• mogu da se uključe u realizaciju međunarodnih naučnih projekata u oblasti menadžmenta i poslovne ekonomije;
• sposobnost praćenja savremenih naučnih i stručnih dostignuća u oblasti modeliranja i optimizacije poslovnih procesa, razvoja teorije odlučivanja, razvoja organizacije sistema i menadžmenta i poslovne ekonomije, uopšte;
• sposobnosti transfera i implementacije naučnih saznanja u nove postupke, metode i veštine upravljanja poslovnim sistemima i resursima, i
• sposobnosti upotrebe informaciono-komunikacionih tehnologija u ovladavanju i praćenju razvoja naučnih i stručnih znanja u oblasti menadžmenta i poslovne ekonomije i primeni ovih tehnologija u modeliranju i optimizaciji poslovnih procesa i donošenju pravovremenih i optimalnih poslovnih odluka. 

Ciljevi doktorskih studija menadžmenta uključuju postizanje naučnih sposobnosti i akademskih veština, razvoj kreativnih sposobnosti i ovladavanje specifičnim praktičnim veštinama potrebnim za razvoj karijere, a svode se prevashodno na sledeće:

• samostalno rešavaju praktične i teorijske probleme u oblasti menadžmenta i poslovne ekonomije;
• mogu da se uključe u realizaciju međunarodnih naučnih projekata u oblasti menadžmenta i poslovne ekonomije;
• mogu da koncipiraju i realizuju programe istraživanja u cilju razvoja novih metoda i postupaka menadžmenta, modeliranja i optimizacije poslovnih procesa i razvoja teorije odlučivanja;
• samostalno kritički ocenjuju i vrednuju postojeća znanja i da saglasno tome naučno-stručno deluju kreativno i nezavisno;
• poštuju principe etičkog kodeksa dobre naučne prakse;
• komuniciraju na profesionalnom nivou u saopštavanju naučno-istraživačkih rezultata;
• osposobljeni da rezultate naučnoistraživačkog rada saopštavaju na naučno-stručnim konferencijama , objavljuju u naučnim časopisima  i materi-jalizuju kroz odgovarajuća patentirana rešenja, i
• doprinose razvoju nauke o menadžmentu i nauke uopšte.

Ciljevi doktorskih studija menadžmenta su usklađeni sa savremenim pravcima razvoja ove naučne discipline u svetu, a svode se prevashodno na sledeće:

• temeljno poznavanje i razumevanje nauke i struke u oblasti menadžmenta sa razvijenim sposobnostima za samostalan i timski naučnoistraživački rad, kritičku ocenu i vrednovanje postojećih i razvoj novih znanja;
• sposobnost rešavanja naučnih i stručnih problema u oblasti menadžmenta i poslovne ekonomije, primenom naučnih metoda i postupaka;
• sposobnost praćenja savremenih naučnih i stručnih dostignuća u oblasti modeliranja i optimizacije poslovnih procesa, razvoja teorije odlučivanja, razvoja organizacije sistema i menadžmenta i poslovne ekonomije, uopšte;
• sposobnosti transfera i implementacije naučnih saznanja u nove postupke, metode i veštine upravljanja poslovnim sistemima i resursima, i
• sposobnosti upotrebe informaciono-komunikacionih tehnologija u ovladavanju i praćenju razvoja naučnih i stručnih znanja u oblasti menadžmenta i poslovne ekonomije i primeni ovih tehnologija u modeliranju i optimizaciji poslovnih procesa i donošenju pravovremenih i optimalnih poslovnih odluka. 

Uspešnim okončanjem Programa doktorskih studija menadžmenta, studenti stiču sledeće opšte kompetencije i razvijene sposobnosti da:

• samostalno rešavaju praktične i teorijske probleme u oblasti menadžmenta i poslovne ekonomije;
• mogu da se uključe u realizaciju međunarodnih naučnih projekata u oblasti menadžmenta i poslovne ekonomije;
• mogu da koncipiraju i realizuju programe istraživanja u cilju razvoja novih metoda i postupaka menadžmenta, modeliranja i optimizacije poslovnih procesa i razvoja teorije odlučivanja;
• samostalno kritički ocenjuju i vrednuju postojeća znanja i da saglasno tome naučno-stručno deluju kreativno i nezavisno;
• poštuju principe etičkog kodeksa dobre naučne prakse;
• komuniciraju na profesionalnom nivou u saopštavanju naučno-istraživačkih rezultata;
• su osposobljeni da rezultate naučnoistraživačkog rada saopštavaju na naučno-stručnim konferencijama , objavljuju u naučnim časopisima  i materi-jalizuju kroz odgovarajuća patentirana rešenja, i
• doprinose razvoju nauke o menadžmentu i nauke uopšte.

Uspešnim okončanjem Programa doktorskih studija menadžmenta, studenti stiču sledeće  predmetno-specifične kompetencije:

• temeljno poznavanje i razumevanje nauke i struke u oblasti menadžmenta sa razvijenim sposobnostima za samostalan i timski naučnoistraživački rad, kritičku ocenu i vrednovanje postojećih i razvoj novih znanja;
• sposobnost rešavanja naučnih i stručnih problema u oblasti menadžmenta i poslovne ekonomije, primenom naučnih metoda i postupaka;
• sposobnost praćenja savremenih naučnih i stručnih dostignuća u oblasti modeliranja i optimizacije poslovnih procesa, razvoja teorije odlučivanja, razvoja organizacije sistema i menadžmenta i poslovbne ekonomije, uopšte;
• sposobnosti transfera i implementacije naučnih saznanja u nove postupke, metode i veštine upravljanja poslovnim sistemima i resursima, i
• sposobnosti upotrebe informaciono-komunikacionih tehnologija u ovladavanju i praćenju razvoja naučnih i stručnih znanja u oblasti menadžmenta i poslovne ekonomije i primeni ovih tehnologija u modeliranju i optimizaciji poslovnih procesa i donošenju pravovremenih i optimalnih poslovnih odluka.

Kurikulum studijskog programa doktorskih studija je u skladu sa Standardom i Preporukama i dopunskim uputstvima za pripremu dokumentacije za akreditaciju.

Doktorske studije menadžmenta obuhvataju četiri obavezna predmeta teorijsko-metodološkog karaktera, jedan izborni predmet iz užeg naučnog područja u kojoj se kandidat opredeli da radi doktorsku disertaciju, istraživački studijski rad i kvalifikacioni rad kojim se bira i detaljno obrazlaže tema doktorske disertacije i izradu i odbranu doktorske disertacije.

Struktura studijskog programa u pogledu broja i vrste obaveznih i izbornih predmeta je usklađena sa standardima za akreditaciju,  savremenim pravcima razvoja nauke o menadžmentu i usaglašen sa programima doktorskih studija menadžmenta na vodećim evropskim i svetskim univerzitetima.

Oblici aktivne nastave dati su kroz nedeljni fond časova nastave  i studijskog istraživačkog rada. Nastava se u godini studija odvija  kroz dva semestra, odnosno 30 nedelja. Prosečno nedeljno opterećenje studenata aktivnim oblicima nastave iznosi 20 časova. Kroz zadnja tri semestra, aktivna nastava se svodi samo na studijski istraživački rad u cilju izbora teme i izrade doktorske disertacije.

Od ukupnog fonda časova aktivne nastave na obaveznim i izbornim predmetima 25% se realizuje putem predavanja, a 75%  kroz studijski istraživački rad, konsultacije i mentorski rad u cilju potpunog ovladavanja metodologijama istraživanja, obrade rezultata i pisanja radova. Uspešnim savladavanjem programa studija na odgovarajućem predmetu stiče se odgovarajući broj ESPB bodova , u skladu sa potrebnim vremenom za savladavanje studijskog programa. Za svaki predmet dat je cilj sa očekivanim ishodima, znanjima i kompetencijama, sadržaj, literatura, metode izvođenja nastave, način provere znanja i ocenjivanje i predmetni nastavnik.

Od ukupnog broja ESPB bodova (180) koji se stiče uspešnim završetkom doktorskih studija, 72 ESPB boda (40 %) pripada obaveznim predmetima, a 108 ESPB bodova  (60 %) izbornom predmetu i aktivnostima u neposrednoj izradi i odbrani doktorske disertacije.

Neposrednom izboru teme, izradi i odbrani doktorske disertacije pripada ukupno 90 ESPB bodova, od čega 30 bodova studijskom istraživačkom radu i kvalifikacionom radu za izbor teme doktorske disertacije, a 60 ESPB bodova izradi i uspešnoj odbrani doktorske disertacije, što je u skladu sa standardima za akreditaciju.

Za prijavu teme doktorske disertacije, kandidat treba da ispuni sledeće uslove:

• uspešno položeni svi ispiti iz obaveznih predmeta
• izveden odgovarajući studijski istraživački rad i urađen kvalifikacioni rad za izbor teme doktorske disertacije koji je pozitivno ocenjen od mentora. Kvalifikacionim radom kandidat treba da pokaže da apsolutno vlada teorijom i praksom u užoj naučnoj oblasti u kojoj želi da radi doktorsku disertaciju kao i da odgovarajućim obrazloženjem dokaže da predložena tema može biti predmet doktorske disertacije, kroz koju će kandidat dati originalan doprinos nauci o menadžmentu.

Kandidat može da pristupi odbrani doktorske disertacije ako su ispunjeni sledeći uslovi:

• položeni svi ispiti;
• ima najmanje dva rada objavljena ili prihvaćena za objavljivanje u naučnim časopisima sa recenzijama sa zvanične liste Ministarstva za nauku i tehnologiju Republike Srbije, ili jedan rad u međunarodnom časopisu sa SCI liste, iz okvira teme doktorske disertacije; i
• pozitivno ocenjena doktorska disertacija od tročlane komisije

Program je usklađen sa savremenim svetskim doktorskim studijskim programima menadžmenta i biznisa. Uporediv je sa više studijskih programa priznatih univerziteta, pre svega u Evropi. Nudi studentima savremena naučna znanja iz oblasti menadžmenta i biznisa.

Program je usklađen sa akreditovanim doktorskim studijskim programima sledećih univerziteta i fakulteta:

1. University of Essex International Akademy, Wivenhoe Park, Colchester CO4 3SQ, United Kingdom (www.essex.ac.uk), BSc in Business Management.
2. International University of Monaco (IUM), 2, Avenue Albert II, MC 98000 Monte - Carlo, Principality of Monaco (www.monaco.edu), and Bachelor of Science in Business Administration Management.
3. University of Ljubljana, Fakulty of Economics, Kardeljeva Ploščad 17, SI-1000 Ljubljana, Slovenia (www.ef.uni-lj.si)

Saglasno potencijalnom, pre svega, mladom naučnom potencijalu na području Timočke Krajine, kao i društvenim  potrebama i potrebama razvoja nauke i obrazovanja u oblasti menadžmenta i poslovne ekonomije, a primereno prostornim i kadrovskim mogućnostima, Fakultet upisuje godišnje 5 studenata na doktorske studije menadžmenta.

Na doktorske studije menadžmenta mogu se upisati kandidati koji su:

• završili diplomske akademske studije sa najmanje 300 ESPB bodova i opštom prosečnom ocenom najmanje 8 na osnovnim akademskim i diplomskim akademskim studijama:menadžmenta, biznisa, ekonomije i organizacionih nauka;
• završili studije VII-1 stepena  po ranije važećim propisima sa opštom prosečnom ocenom najmanje 8, u oblasti menadžmenta, biznisa, ekonomije i organizacionih nauka, i
• završili studije u drugim naučnim poljima i oblastima, ako imaju najmanju prosečnu ocenu  na prethodnim studijama 8 i polože diferencijalne ispite iz predmeta: Ekonomija i Menadžment po programu za osnovne akademske studije.

Studenti savlađuju studijski program doktorskih studija  polaganjem  pet ispita (četiri obavezna i jedan izborni predmet), pozitivno ocenjenim kvalifikacionim radom za izbor teme i izradom i uspešnom javnom odbranom disertacije, čime stiču 180  ESPB bodova.

Svakom predmetu i disertaciji pripada određeni broj ESPB bodova kada se položi ispit. Broj bodova po predmetima utvrđen je na osnovu opterećenja studenata u savlađivanju gradiva predmeta, a na osnovu jedinstvene metodologije utvrđene u Pravilniku o organizaciji nastave i polaganju ispita na Megatrend univerzitetu i Fakultetu za menadžment u Zaječaru.

Uspešnost u savlađivanju gradiva iz određenog predmeta  prati nastavnik i izražava određenim brojem poena . Maksimalan broj poena na predmetu je 100. Student stiče poene kroz rad u aktivnoj nastavi, ispunjavanjem predispitnih obaveza i polaganjem završnog ispita. Minimalni broj poena koji student može da stekne ispunjavanjem predispitnih obaveza   je 30 (teorijsko-metodološki), a maksimalni 70 (naučno-stručni predmeti).

Ukupan uspeh studenta na predmetu izražava se ocenom od 5 (nedovoljno) do 10 (odlično-izuzetno).

Disertacija je završni deo studijskog programa doktorskih studija. Disertacija predstavlja samostalni naučnoistraživački rad studenta kojim se daje originalan naučni doprinos u oblasti menadžmenta. Ostvareni naučni doprinos u disertaciji ocenjuje se prema broju i vrsti naučnih publikacija i patentiranih rešenja, proisteklih iz disertacije.

U knjizi predmeta daje se specifikacija disertacije, koja sadrži: uslove za prijavu i odobrenje teme, ciljeve, očekivane ishode, strukturu sadržaja i metode izrade.  Pisanom tekstu disertacije pripada najviše 70, a javnoj odbrani najviše 30 poena.

Uslovi za prijavu i odobrenje teme doktorske disertacije su položeni ispiti iz obaveznih predmeta i pozitivno ocenjen kvalifikacioni rad za izbor teme disertacije od mentora.

Uslovi za pristupanje odbrani doktorske disertacije su:

• položeni svi ispiti;
• najmanje dva rada objavljena ili prihvaćena za objavljivanje u naučnim časopisima sa recenzijama sa zvanične liste Ministarstva za nauku i tehnologiju Republike Srbije, ili jedan rad u međunarodnom časopisu sa SCI liste, iz okvira teme doktorske disertacije.
• pozitivno ocenjen tekst doktorske disertacije od strane komisije koju određuje Nastavno-naučno veće.